Pesquisa | BVS IEC

1.

Full-length 16S rRNA gene sequencing by PacBio improves taxonomic resolution in human microbiome samples.

Buetas, Elena; Jordán-López, Marta; López-Roldán, Andrés; D'Auria, Giuseppe; Martínez-Priego, Llucia; De Marco, Griselda; Carda-Diéguez, Miguel; Mira, Alex.

BMC Genomics ; 25(1): 310, 2024 Mar 25.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38528457

2.

Genome sequences of BCG Pasteur ATCC 35734 and its derivative, the vaccine candidate BCGΔBCG1419c.

D'Auria, Giuseppe; Hodzhev, Yordan; Aceves-Sánchez, Michel de Jesús; Moya, Andrés; Panaiotov, Stefan; Flores-Valdez, Mario Alberto.

BMC Genomics ; 24(1): 69, 2023 Feb 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36765273

3.

The C-terminal region of the Hot1 transcription factor binds GGGACAAA-related sequences in the promoter of its target genes.

Gomar-Alba, Mercè; Amaral, Catarina; Artacho, Alejandro; D'Auria, Giuseppe; Pimentel, Catarina; Rodrigues-Pousada, Claudina; lí del Olmo, Marcel.

Biochim Biophys Acta ; 1849(12): 1385-97, 2015 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26470684

4.

Comparison of culture-dependent and independent approaches to characterize fecal bifidobacteria and lactobacilli.

Quartieri, Andrea; Simone, Marta; Gozzoli, Caterina; Popovic, Mina; D'Auria, Giuseppe; Amaretti, Alberto; Raimondi, Stefano; Rossi, Maddalena.

Anaerobe ; 38: 130-137, 2016 Apr.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26481833

5.

Revealing microbial recognition by specific antibodies.

Simón-Soro, Áurea; D'Auria, Giuseppe; Collado, M Carmen; Dzunková, Mária; Culshaw, Shauna; Mira, Alex.

BMC Microbiol ; 15: 132, 2015 Jul 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-26134992

6.

Complete Genome Sequences of Two Lytic Phages of Salmonella enterica Isolated from Wastewater in Ecuador.

Parra, Manuela; Bayas-Rea, Rosa de Los Ángeles; Guerrero, Teresa; Torres, Stuart; D'Auria, Giuseppe; Reyes-Prieto, Mariana; Zapata, Sonia.

Microbiol Resour Announc ; 12(2): e0104822, 2023 Feb 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36651741

7.

Influence of perinatal and childhood exposure to tobacco and mercury in children's gut microbiota.

Pérez-Castro, Sonia; D'Auria, Giuseppe; Llambrich, Maria; Fernández-Barrés, Sílvia; Lopez-Espinosa, Maria-Jose; Llop, Sabrina; Regueiro, Benito; Bustamante, Mariona; Francino, M Pilar; Vrijheid, Martine; Maitre, Léa.

Front Microbiol ; 14: 1258988, 2023.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38249448

8.

Changes in liver metabolic pathways demonstrate efficacy of the combined dietary and microbial therapeutic intervention in MASLD mouse model.

Iannone, Valeria; Babu, Ambrin Farizah; Lok, Johnson; Gómez-Gallego, Carlos; D'Auria, Giuseppe; Vazquez-Uribe, Ruben; Vaaben, Troels Holger; Bongers, Mareike; Mikkonen, Santtu; Vaittinen, Maija; Tikkanen, Ida; Kettunen, Mikko; Klåvus, Anton; Sehgal, Ratika; Kaminska, Dorota; Pihlajamaki, Jussi; Hanhineva, Kati; El-Nezami, Hani; Sommer, Morten Otto Alexander; Kolehmainen, Marjukka.

Mol Metab ; 78: 101823, 2023 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37839774

9.

Phylogenomic evidence for the presence of a flagellum and cbb(3) oxidase in the free-living mitochondrial ancestor.

Sassera, Davide; Lo, Nathan; Epis, Sara; D'Auria, Giuseppe; Montagna, Matteo; Comandatore, Francesco; Horner, David; Peretó, Juli; Luciano, Alberto Maria; Franciosi, Federica; Ferri, Emanuele; Crotti, Elena; Bazzocchi, Chiara; Daffonchio, Daniele; Sacchi, Luciano; Moya, Andres; Latorre, Amparo; Bandi, Claudio.

Mol Biol Evol ; 28(12): 3285-96, 2011 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21690562

10.

Stratified prokaryote network in the oxic-anoxic transition of a deep-sea halocline.

Daffonchio, Daniele; Borin, Sara; Brusa, Tullio; Brusetti, Lorenzo; van der Wielen, Paul W J J; Bolhuis, Henk; Yakimov, Michail M; D'Auria, Giuseppe; Giuliano, Laura; Marty, Danielle; Tamburini, Christian; McGenity, Terry J; Hallsworth, John E; Sass, Andrea M; Timmis, Kenneth N; Tselepides, Anastasios; de Lange, Gert J; Hübner, Andreas; Thomson, John; Varnavas, Soterios P; Gasparoni, Francesco; Gerber, Hans W; Malinverno, Elisa; Corselli, Cesare; Garcin, Jean; McKew, Boyd; Golyshin, Peter N; Lampadariou, Nikolaos; Polymenakou, Paraskevi; Calore, Daniele; Cenedese, Stefano; Zanon, Fabio; Hoog, Sven.

Nature ; 440(7081): 203-7, 2006 Mar 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-16525471

11.

Sulfur cycling and methanogenesis primarily drive microbial colonization of the highly sulfidic Urania deep hypersaline basin.

Borin, Sara; Brusetti, Lorenzo; Mapelli, Francesca; D'Auria, Giuseppe; Brusa, Tullio; Marzorati, Massimo; Rizzi, Aurora; Yakimov, Michail; Marty, Danielle; De Lange, Gert J; Van der Wielen, Paul; Bolhuis, Henk; McGenity, Terry J; Polymenakou, Paraskevi N; Malinverno, Elisa; Giuliano, Laura; Corselli, Cesare; Daffonchio, Daniele.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 106(23): 9151-6, 2009 Jun 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-19470485

12.

Rapid Oxford Nanopore Technologies MinION Sequencing Workflow for Campylobacter jejuni Identification in Broilers on SiteA Proof-of-Concept Study

Marin, Clara; Marco-Jiménez, Francisco; Martínez-Priego, Llucia; De Marco-Romero, Griselda; Soriano-Chirona, Vicente; Lorenzo-Rebenaque, Laura; D'Auria, Giuseppe.

Animals (Basel) ; 12(16)2022 Aug 13.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36009653

13.

Genome sequence of Lactococcus garvieae UNIUD074, isolated in Italy from a lactococcosis outbreak.

Reimundo, Pilar; Pignatelli, Miguel; Alcaraz, Luis David; D'Auria, Giuseppe; Moya, Andrés; Guijarro, José A.

J Bacteriol ; 193(14): 3684-5, 2011 Jul.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21602331

14.

Complete genome sequence of Acidaminococcus intestini RYC-MR95, a Gram-negative bacterium from the phylum Firmicutes.

D'Auria, Giuseppe; Galán, Juan-Carlos; Rodríguez-Alcayna, Manuel; Moya, Andrés; Baquero, Fernando; Latorre, Amparo.

J Bacteriol ; 193(24): 7008-9, 2011 Dec.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-22123762

15.

Assessing gut microbial diversity from feces and rectal mucosa.

Durbán, Ana; Abellán, Juan J; Jiménez-Hernández, Nuria; Ponce, Marta; Ponce, Julio; Sala, Teresa; D'Auria, Giuseppe; Latorre, Amparo; Moya, Andrés.

Microb Ecol ; 61(1): 123-33, 2011 Jan.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-20734040

16.

Profiling the Bladder Microbiota in Patients With Bladder Cancer.

Parra-Grande, Mónica; Oré-Arce, Martín; Martínez-Priego, Llúcia; D'Auria, Giuseppe; Rosselló-Mora, Ramón; Lillo, Marta; Sempere, Andrea; Lumbreras, Blanca; Sánchez-Hellín, Victoria.

Front Microbiol ; 12: 718776, 2021.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35197936

17.

Analysis of the Gut Microbiota: An Emerging Source of Biomarkers for Immune Checkpoint Blockade Therapy in Non-Small Cell Lung Cancer.

Zhang, Feiyu; Ferrero, Macarena; Dong, Ning; D'Auria, Giuseppe; Reyes-Prieto, Mariana; Herreros-Pomares, Alejandro; Calabuig-Fariñas, Silvia; Duréndez, Elena; Aparisi, Francisco; Blasco, Ana; García, Clara; Camps, Carlos; Jantus-Lewintre, Eloisa; Sirera, Rafael.

Cancers (Basel) ; 13(11)2021 May 21.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34063829

18.

Evolutionary and Phenotypic Characterization of Two Spike Mutations in European Lineage 20E of SARS-CoV-2.

Ruiz-Rodriguez, Paula; Francés-Gómez, Clara; Chiner-Oms, Álvaro; López, Mariana G; Jiménez-Serrano, Santiago; Cancino-Muñoz, Irving; Ruiz-Hueso, Paula; Torres-Puente, Manuela; Bracho, Maria Alma; D'Auria, Giuseppe; Martinez-Priego, Llúcia; Guerreiro, Manuel; Montero-Alonso, Marta; Gómez, María Dolores; Piñana, José Luis; González-Candelas, Fernando; Comas, Iñaki; Marina, Alberto; Geller, Ron; Coscolla, Mireia.

mBio ; 12(6): e0231521, 2021 12 21.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34781748

19.

Effect of Mastiha supplementation on NAFLD: The MAST4HEALTH Randomised, Controlled Trial.

Amerikanou, Charalampia; Kanoni, Stavroula; Kaliora, Andriana C; Barone, Angela; Bjelan, Mladen; D'Auria, Giuseppe; Gioxari, Aristea; Gosalbes, María José; Mouchti, Sofia; Stathopoulou, Maria G; Soriano, Beatriz; Stojanoski, Stefan; Banerjee, Rajarshi; Halabalaki, Maria; Mikropoulou, Eleni V; Kannt, Aimo; Lamont, John; Llorens, Carlos; Marascio, Fernando; Marascio, Miriam; Roig, Francisco J; Smyrnioudis, Ilias; Varlamis, Iraklis; Visvikis-Siest, Sophie; Vukic, Milan; Milic, Natasa; Medic-Stojanoska, Milica; Cesarini, Lucia; Campolo, Jonica; Gastaldelli, Amalia; Deloukas, Panos; Trivella, Maria Giovanna; Francino, M Pilar; Dedoussis, George V.

Mol Nutr Food Res ; 65(10): e2001178, 2021 05.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33629536

20.

The first wave of the COVID-19 epidemic in Spain was associated with early introductions and fast spread of a dominating genetic variant.

López, Mariana G; Chiner-Oms, Álvaro; García de Viedma, Darío; Ruiz-Rodriguez, Paula; Bracho, Maria Alma; Cancino-Muñoz, Irving; D'Auria, Giuseppe; de Marco, Griselda; García-González, Neris; Goig, Galo Adrian; Gómez-Navarro, Inmaculada; Jiménez-Serrano, Santiago; Martinez-Priego, Llúcia; Ruiz-Hueso, Paula; Ruiz-Roldán, Lidia; Torres-Puente, Manuela; Alberola, Juan; Albert, Eliseo; Aranzamendi Zaldumbide, Maitane; Bea-Escudero, María Pilar; Boga, Jose Antonio; Bordoy, Antoni E; Canut-Blasco, Andrés; Carvajal, Ana; Cilla Eguiluz, Gustavo; Cordón Rodríguez, Maria Luz; Costa-Alcalde, José J; de Toro, María; de Toro Peinado, Inmaculada; Del Pozo, Jose Luis; Duchêne, Sebastián; Fernández-Pinero, Jovita; Fuster Escrivá, Begoña; Gimeno Cardona, Concepción; González Galán, Verónica; Gonzalo Jiménez, Nieves; Hernáez Crespo, Silvia; Herranz, Marta; Lepe, José Antonio; López-Causapé, Carla; López-Hontangas, José Luis; Martín, Vicente; Martró, Elisa; Milagro Beamonte, Ana; Montes Ros, Milagrosa; Moreno-Muñoz, Rosario; Navarro, David; Navarro-Marí, José María; Not, Anna; Oliver, Antonio.

Nat Genet ; 53(10): 1405-1414, 2021 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34594042

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